紫外线消毒器的杀菌原理是当水流经饮用水紫外线消毒时，紫外线光照射于细菌、病毒，其细胞及结构就会被破坏导致死亡，从而达到杀菌的目的。由于饮用水紫外线消毒设备采用的是紫外线杀菌，不添加任何化学品，所以对水无二次污染。
1、降低余氯
泳池水中的氯含量降低，减少了消毒副产品，令泳池环境更健康。
2、降低氯的投放量
当氯与游泳人士身上的有机复合物反应，就产生消毒副产品，如氯胺。这些副产品是导致人们双眼和呼吸不适的根源。氯胺具有腐蚀性，会侵蚀泳池壁和水管。 通过将全循环水流暴露在紫外照射下，紫外线灯能将氯的使用量降到要求的范围以内。
3、减少三卤甲烷
在利用氯消毒的池水里，其中一种消毒副产品是三卤甲烷(THMs)。zui常见的是三氯甲烷，它是一种怀疑致癌物质。游泳池水紫外线消毒器的应用，配合降低了氯剂量，减少池水中的三氯甲烷含量。
4、杀灭泳池和淋浴池里的军团菌
军团菌是泳池中和温水循环淋浴池中出现的、极为危险的致病微生物。它能对抗余氯，但会被紫外光杀灭。温度不会影响紫外光作用，因此对温水浴池极为适合。
5、杀灭微生物
游泳池水紫外线消毒器的应用另一好处，是能够*灭活抗氯性微生物组织，例如嗜肺军团菌、大肠杆菌、假单胞菌、隐孢子虫、阿米巴虫和细菌。紫外线通过破坏这些微生物的DNA和DNA修复酶来达到灭活效果。
